Прогнозування In Silico біологічної активності перефункціоналізованих похідних аміно-9,10-антрацендіонів

2017;
: pp. 203-215
1
Національний університет „Львівська політехніка”
2
Національний університет „Львівська політехніка”
3
Національний університет „Львівська політехніка”
4
Національний університет „Львівська політехніка”
5
Lviv Polytechnic National University

Здійснено комп'ютерний прогноз біологічної активності нових похідних 9,10-антрацендіону – 1,2,3-триазолів, дитіокарбаматів, гідразонів, із застосуванням програм PASS Online, Cell Line Cytotoxicity Predictor та Antiviral Compound Prediction. Показано, що для переважної більшості сполук спрогнозована протипухлинна активність, яка в деяких випадках доповнюється антивірусною. Проведена комп’ютерна (in silico) оцінка афінності даного типу систем при використанні молекулярного докінгу, яка була порівняна із відповідними значеннями відомих протипухлинних препаратів мітоксантрона та іматініба. Встановлено, що для досліджених структур найвищий рівень зв’язування (-9.44…-10.92) виявлений до сімейства рецепторних тирозинкіназPDGF (код білка 1T46). Продемонстровано, що синтезовані нові системи відзначаються значенням скорингової функції Gscore на рівні модельного об’єкта.

The computer prediction of biological activity of the new derivatives of 9,10-anthracenedione – 1,2,3-triazoles, dithiocarbamates, hydrazones usingthe program PASS Online, Cell Line Cytotoxicity Predictor та Antiviral Compound Prediction was carryed out. Anticancer and sometimes antiviral activities have been shown for majority of compounds. The computer (in silico) estimation of affinity of this systems type using molecular docking was carried out. The affinity was compared with the corresponding values of ​​known anticancer agents – mitoxanthrone and imatinib. It is established that the proposed compoundshave highest level of binding (-9.44 ...-10.92) to the family of receptor tyrosine kinases PDGF (protein code 1T46). It was demonstrated that new synthesized systems have scoring function Gscore on the level of the model object.

1. Huang Q., Lu G., Shen H.M., Chung M.C.M., Choon N.O. Anti-cancer properties of anthraquinones from Rhubarb. Med. Res. Rev. 2007. – Vol. 27(5). – P.609-630.  2. Murdock K.C., Child R.G., Fabio P.F., Angier R.B., Wallace R.E., Durr F.E., Citarella R.V. Antitumor Agents. I. 1,4-Bis[(aminoalkyl)amino]-9,l0-anthracenediones. J. Med. Chem. – 1979. – Vol. 22(9). – P.1024-1030.  3. Shrestha J.P., Fosso M.Y., Bearss J., Chang C.-W.T. Synthesis and anticancer structure activity relationship investigation of cationic anthraquinone analogs. Eur. J. Med. Chem. – 2014. – Vol.77. – P.96-102. 4. Shrestha J.P., Subedi Y.P., Chen L., Chang C.-W.T. A mode of action study of cationic anthraquinoneanalogs: A new class of highly potent anticancer agents. Med. Chem.Comm. – 2015. – Vol.6(11). – P.2012-2022.5.Thomson Reuters IntegritySM. Thomson ReutersTM; software available at http://thomsonreuters.com/en/products-services/pharma-life-sciences/pharmaceutical-research/integrity.html6. Fox E.J. Mechanism of action of mitoxantrone. Neurology. – 2004. – Vol. 63(12 Suppl 6). – S15–S18. 7. Nitiss J.L.Targeting DNA topoisomerase II in cancer chemotherapy. Nat. Rev. Cancer. – 2009. – Vol. 9(5). –P.338-350.8. Wu C.-C., Li Y.-C., Wang Y.-R., Li T.-K., Chan N.-L. On the structural basis and design guidelines for type II topoisomerase-targeting anticancer d rugs. Nucleic Acids Res. – 2013. – Vol. 41(22). – P.10630-10640. 9. Malik E.M., Muller Ch.E.. Anthraquinones as PharmacologicalTools and Drugs.Med. Res. Rev.– 2016. – Vol. 36(4). – P. 705-748. 10. Liang Z., Ai J., Ding X., Peng X., Zhang D., Zhang R., Wang Y., Liu F., Zheng M., Jiang H., Liu H., GengM., Luo C. Anthraquinone derivatives as potent inhibitors of c-Met kinase and the extracellular signaling pathway. ACS Med. Chem. Lett. – 2013.  – Vol. 4(4). – P.408-413. 11. Lagunin A., Stepanchikova A., Filimonov D., Poroikov V. PASS: prediction of activity spectra for biologically active substances. Bioinformatics. – 2000. – Vol. 16, № 8. – P. 747-748. 12.Stasevych M., Zvarych V., Lunin V., Vovk M., Novikov V. The new 1,2,3-triazolylantracene-9,10-diones: synthesis and computer bioactivity screening. Chem. & Chem. Tech. – 2017. – Vol. 11(1). – P. 1-9. 13. Zvarych V., Stasevych M., Lunin V. et al. Synthesis and investigation of antioxidant activity of the dithiocarbamates derivatives of 9,10-anthracenedione. Monatsh. Chem. – 2016. –Vol. 147(12). – P. 2093-2101. 14.Стасевич М.В., Зварич В.И., Лунин В.В., Вовк М.В., Новиков В.П.. Удобный метод синтеза 1-гидразинилантрацен-9,10-дионов. Журн. Орг. Хим. – 2017. - Т. 53. Вып. 3. – C.438-440.15.Qureshi A., Kaur G., Kumar M. AVCpred: An integrated web server for prediction and design of antiviral compounds. Chem. Biol. Drug. Des. – 2017. – Vol. 89. – P. 74-83. 16. Konova V., Lagunin A., Pogodin P., Kolotova E., Shtil A., Poroikov V. Virtual Screening of Chemical Compounds Active Against Breast Cancer Cell Lines Based on Cell Cycle Modeling, Prediction of Cytotoxicity and Interaction with Targets. SAR & QSAR Environ. Res. 2014. – Vol. 26. -P. 595-604.17. R. Friesner A., Murphy R.B., Repasky M.P.et. al. Extra Precision Glide: Docking and Scoring Incorporating a Model of Hydrophobic Enclosure for Protein-Ligand Complexes. J. Med. Chem. – 2006. – Vol. 49. – P. 6177-6196. 18. The Protein Data Bank [Електронний ресурс], H. M. Berman, J. Westbrook, Z. Feng et. al.  Nucleic Acids Research. – 2000. – Vol. 28. –P. 235–242.