Розроблено атомістичну модель для молекулярно-динамічного моделювання (МД) нерозгалуженої поліакрилової кислоти (ПАК), яка містить два піренові зонди на кінцях ланцюга. За результатами МД моделювання будови та конформаційної поведінки пірен-міченої ПАК як функції ступеня дисоціації карбоксильних груп (α) встановлено, що піренові замісники здатні суттєво впливати на конформаційну поведінку ПАК. При кислому рН (α = 0) полімерний ланцюг ПАК згортається у форму глобули, при цьому два піренові замісника утворюють π-π стекінгові дімери. Однак, в лужному рН (α = 1) ПАК ланцюг розгортається та вивільняє піренові зонди у водне середовище.
- Duhamel J.: 7-Pyrene Fluorescence to Study Polymeric Systems [in:] Chen P. (Ed.), Molecular Interfacial Phenomena of Polymers and Biopolymers. Woodhead Publishing, 2005, 214-248. https://doi.org/10.1533/9781845690830.2.214
- Saroj S., Rajput S.: Drug Dev. Ind. Pharm., 2018, 44, 1198. https://doi.org/10.1080/03639045.2018.1438467
- Wei M., Gao Y., Li X., Serpe M.: Polym. Chem., 2017, 8, 127. https://doi.org/10.1039/C6PY01585A
- Arora K., Hwang K., Turro N.: Macromolecues, 1986, 19, 2806. https://doi.org/10.1021/ma00165a025
- Kramer M., Steger J., Hu Y., McCormick C.: Macromolecules, 1996, 29, 1992. https://doi.org/10.1021/ma951087p
- Winnik F.: Chem. Rev., 1993, 93, 587. https://doi.org/10.1021/cr00018a001
- Costa T., Miguel Md., Lindman B. et al.: J. Phys. Chem. B, 2005, 109, 11478. https://doi.org/10.1021/jp050236v
- Pokhrel M., Bossmann S.: J. Phys. Chem. B, 2000, 104, 2215. https://doi.org/10.1021/jp9917190
- Farhangi S., Casier R., Li L. et al.: Macromolecules, 2016, 49, 9597. https://doi.org/10.1021/acs.macromol.6b02455
- Seixas de Melo J., Costa T., Miguel Md. et al.: J. Phys. Chem. B, 2003, 107, 12605. https://doi.org/10.1021/jp0346054
- Liu F., Urban M.: Prog. Polym. Sci., 2010, 35, 3. https://doi.org/10.1016/j.progpolymsci.2009.10.002
- Costa T., de Melo S., Castro C. et al.: J. Phys. Chem. B, 2010, 114, 12439. https://doi.org/10.1021/jp1020214
- Ramos J., Forcada J., Hidalgo-Alvarez R.: Chem. Rev., 2014, 114, 367. https://doi.org/10.1021/cr3002643
- Schmaljohann D.: Adv. Drug Delivery Rev., 2006, 58, 1655. https://doi.org/10.1016/j.addr.2006.09.020
- Wang S., Huang P., Chen X.: ACS Nano, 2016, 10, 2991. https://doi.org/10.1021/acsnano.6b00870
- Motornov M., Roiter Y., Tokarev I., Minko S.: Prog. Polym. Sci., 2010, 35, 174. https://doi.org/10.1016/j.progpolymsci.2009.10.004
- Gao Y., Ahiabu A., Serpe M.: ACS Appl. Mater. Inter., 2014, 6, 13749. https://doi.org/10.1021/am503200p
- Feng N., Dong J., Han G., Wang G.: Macromol. Rapid Commun., 2014, 35, 721. https://doi.org/10.1002/marc.201300863
- Payne W., Svechkarev D., Kyrychenko A., Mohs A.: Carbohydr. Polym., 2018, 182, 132. https://doi.org/https://doi.org/10.1016/j.carbpol.2017.10.054
- Zhou X., Zhao K.: Phys. Chem. Chem. Phys., 2017, 19, 20559. https://doi.org/10.1039/C7CP02460F
- Qin S., Yong X.: Soft Matter., 2017, 13, 5137. https://doi.org/10.1039/C7SM00637C
- Katiyar R., Jha P.: Polymer, 2017, 114, 266. https://doi.org/10.1016/j.polymer.2017.03.007
- Sharma A., Smith J., Walters K., Rick S.: J. Chem. Phys., 2016, 145, 234906. https://doi.org/10.1063/1.4972062
- Patel K., Chockalingam R., Natarajan U.: Mol. Simul., 2017, 43, 691. https://doi.org/10.1080/08927022.2017.1295454
- Jha K., Desai S., Li J., Larson G.: Polymers, 2014, 6, 1414. https://doi.org/10.3390/polym6051414
- Reith D., Müller B., Müller-Plathe F., Wiegand S.: J. Chem. Phys., 2002, 116, 9100. https://doi.org/10.1063/1.1471901
- Chockalingam R., Natarajan U.: Mol. Simul., 2015, 41, 1110. https://doi.org/10.1080/08927022.2014.947481
- Sappidi P., Natarajan U.: J. Mol. Graphics Model., 2017, 75, 306. https://doi.org/https://doi.org/10.1016/j.jmgm.2017.04.007
- Sulatha M., Natarajan U.: Ind. Eng. Chem. Res., 2011, 50, 11785. https://doi.org/10.1021/ie2014845
- Kyrychenko A., Korsun O., Gubin I. et al.: J. Phys. Chem. C, 2015, 119, 7888. https://doi.org/10.1021/jp510369a
- Kyrychenko A., Pasko D., Kalugin O.: Phys. Chem. Chem. Phys., 2017, 19, 8742. https://doi.org/10.1039/C6CP05562A
- Berendsen H., Grigera J., Straatsma T.: J. Phys. Chem., 1987, 91, 6269. https://doi.org/10.1021/j100308a038
- Bussi G., Donadio D., Parrinello M.: J. Chem. Phys., 2007, 126, 014101/1. https://doi.org/10.1063/1.2408420
- Darden T., York D., Pedersen L.: J. Chem. Phys., 1993, 98, 10089. https://doi.org/10.1063/1.464397
- Hess B., Bekker H., Berendsen H., Fraaije J.: J. Comput. Chem., 1997, 18, 1463. https://doi.org/10.1002/(SICI)1096-987X(199709)18:12<1463::AID-JCC4>3.0.CO;2-H
- Hess B.: J. Chem. Theory Comput., 2008, 4, 116. https://doi.org/10.1021/ct700200b
- Van Der Spoel D., Lindahl E., Hess B. et al.: J. Comput. Chem., 2005, 26, 1701. https://doi.org/10.1002/jcc.20291
- Humphrey W., Dalke A., Schulten K.: J. Mol. Graphics, 1996, 14, 33. https://doi.org/10.1016/0263-7855(96)00018-5
- Kyrychenko A.: Method. Appl. Fluoresc., 2015, 3, 042003/1. https://doi.org/10.1088/2050-6120/3/4/042003
- Laguecir A., Ulrich S., Labille J. et al.: Eur. Polym. J., 2006, 42, 1135. https://doi.org/10.1016/j.eurpolymj.2005.11.023
- Van Der Spoel D., Lindahl E., Hess B. et al.: Gromacs user manual version 4.5.4. www.gromacs.org, 2010.
- Svechkarev D., Kyrychenko A., Payne W., Mohs A.: Soft Matter., 2018, 14, 4762. https://doi.org/10.1039/C8SM00908B